More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1399 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  690    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  77.45 
 
 		 336 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  57.67 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  48.49 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  44.06 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  43.83 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  43.38 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  43.05 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  41.53 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  44.23 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  40.67 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.39 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  38.87 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  40.53 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.52 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.55 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  40.19 
 
 		 345 aa  242  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  40.19 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  37.71 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  40.67 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.32 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  36.72 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.1 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.19 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.53 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.93 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.26 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.32 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  37.72 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.4 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.33 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.68 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  38.33 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.92 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.18 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.14 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.83 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.13 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.26 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.54 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.2 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.61 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.31 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  37.95 
 
 		 329 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.33 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.98 
 
 		 322 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  37.66 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  37.61 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  40.37 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.86 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.34 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.14 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.35 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.53 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.09 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.53 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.33 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.54 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.31 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.21 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.31 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.05 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.19 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  37.43 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  37.54 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.66 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  37.21 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.78 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.04 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.39 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>