More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0118 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  681    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  99.71 
 
 		 339 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  76.97 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  45.82 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  42.47 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  44.24 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  41.83 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  41.29 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  36.69 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  36.69 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.54 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.92 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.61 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.83 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  39.88 
 
 		 323 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.85 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.91 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.7 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.57 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  37.16 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  36.7 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  38.86 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.05 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  35.28 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.18 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.4 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.67 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.91 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.87 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.38 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.34 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.18 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.2 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.97 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.09 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.48 
 
 		 337 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  36.79 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.6 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  36.21 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.33 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.74 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.33 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  39.85 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  35.67 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  41.42 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.69 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.27 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.48 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.09 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  37.66 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.74 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.04 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.76 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.55 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  35.39 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.26 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.91 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.94 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.06 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.13 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.82 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  37.88 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.12 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.42 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.44 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  34.77 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  33.94 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  36.79 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  34.35 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  36.51 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>