More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5777 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  54.67 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  49.39 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  49.08 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  47.67 
 
 		 334 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  45.17 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  46.51 
 
 		 366 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  43.9 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  43.6 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.62 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  42.48 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.51 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.76 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.49 
 
 		 331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.29 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.79 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.55 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.29 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.62 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.76 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.14 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.96 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  39.26 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.22 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.55 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.55 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  39.43 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.6 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.6 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.52 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.03 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.86 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.3 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.02 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  43.33 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.61 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.3 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.78 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.09 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.78 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  38.13 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.2 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.33 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  40.55 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.97 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.48 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.88 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.99 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.61 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.53 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.53 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.58 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.28 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  37.04 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  41.38 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.1 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  40.6 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.74 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.28 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.4 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.06 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.25 
 
 		 698 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.29 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.39 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  42.62 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.99 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  40.6 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.16 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.06 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.91 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.53 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.69 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>