More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4309 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  77.45 
 
 
339 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  58.67 
 
 
340 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  51.06 
 
 
325 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  47.67 
 
 
324 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  43.99 
 
 
325 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  45.18 
 
 
339 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  45.45 
 
 
339 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  42.95 
 
 
323 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  42.72 
 
 
323 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.34 
 
 
327 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  43.75 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  38.92 
 
 
322 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  41.67 
 
 
340 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  45.51 
 
 
355 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
322 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  40.57 
 
 
345 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  40.57 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.73 
 
 
326 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.19 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.31 
 
 
337 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.27 
 
 
328 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.37 
 
 
358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.66 
 
 
318 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.94 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 
331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 
329 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.25 
 
 
330 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.33 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.76 
 
 
336 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.24 
 
 
326 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.72 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.26 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  40.18 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.3 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.58 
 
 
328 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.33 
 
 
324 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.3 
 
 
331 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.26 
 
 
324 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.53 
 
 
334 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  40.66 
 
 
329 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  39.1 
 
 
334 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.53 
 
 
323 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.82 
 
 
325 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.68 
 
 
322 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.51 
 
 
327 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.06 
 
 
337 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.61 
 
 
304 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.45 
 
 
333 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  39.23 
 
 
324 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.67 
 
 
339 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.67 
 
 
325 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.28 
 
 
335 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.46 
 
 
322 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  39.27 
 
 
322 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.26 
 
 
328 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.8 
 
 
334 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.63 
 
 
356 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 
328 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.98 
 
 
327 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.86 
 
 
322 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.62 
 
 
335 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  39.14 
 
 
322 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.69 
 
 
339 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.16 
 
 
328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.92 
 
 
334 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.87 
 
 
327 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.84 
 
 
339 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.51 
 
 
353 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.88 
 
 
331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.26 
 
 
318 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.27 
 
 
323 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.59 
 
 
324 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.87 
 
 
325 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  38.07 
 
 
322 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.39 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 
329 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.74 
 
 
329 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.74 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.86 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  40.46 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.86 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.51 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.53 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.62 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  39.16 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.09 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.02 
 
 
328 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>