More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5492 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  50.47 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  49.23 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  43.08 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  45.64 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  44.74 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  43.9 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.64 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  43.93 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  42.19 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.43 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  43.99 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  41.08 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  43.73 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.81 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.83 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.94 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.44 
 
 		 339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.8 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.87 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.33 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.33 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  40.84 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 358 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.81 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.38 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  38.81 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.68 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.88 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.19 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.09 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.02 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  42.05 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.81 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.18 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  37.5 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.47 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.33 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.13 
 
 		 362 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  40.73 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.63 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.34 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.2 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  39.08 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.72 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.58 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  41.18 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.12 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  41.82 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  42.42 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.8 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.14 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.91 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.4 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.72 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  41.47 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.99 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.43 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.06 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.48 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.12 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 335 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.8 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  37.79 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.84 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.77 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.65 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.82 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.52 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.4 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  39.64 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.96 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.01 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.96 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.99 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.46 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.16 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>