More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3101 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  88.2 
 
 		 322 aa  587  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  79.46 
 
 		 324 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  75.17 
 
 		 324 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  74.75 
 
 		 317 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  70.71 
 
 		 322 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  66.77 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  70.37 
 
 		 322 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  64.85 
 
 		 333 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  69.93 
 
 		 320 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  62.73 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.95 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.69 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.9 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.87 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.16 
 
 		 343 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.88 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.27 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.52 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.81 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  42.04 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.33 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.52 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.16 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.08 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.39 
 
 		 356 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.26 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.94 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.29 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.84 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.03 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.05 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.2 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.06 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.06 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.74 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.75 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.11 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.47 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  37.96 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.65 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.13 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.81 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.94 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.46 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.75 
 
 		 341 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.66 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.6 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.33 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.67 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.89 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.39 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.14 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.87 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  36.79 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  37.05 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  38.64 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.38 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.92 
 
 		 326 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.75 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  38.17 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.46 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.89 
 
 		 323 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.54 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.2 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.82 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.98 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.51 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.54 
 
 		 327 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.65 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  34.37 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.25 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.2 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  36.11 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  37.88 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.13 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>