More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6086 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  76.02 
 
 		 341 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  57.53 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0889  hypothetical protein  54.45 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.37 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.99 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.9 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.32 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.47 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.29 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.28 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.5 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.16 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.4 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  41.16 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.86 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.53 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.65 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.74 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.42 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.93 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.67 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.34 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  45.18 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.81 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.68 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.58 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.61 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.92 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.09 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.9 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.4 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.8 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.4 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.41 
 
 		 325 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.86 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  37.74 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.92 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  40.53 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.33 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.12 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.79 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.74 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.46 
 
 		 344 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  38.21 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  41.31 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.2 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.07 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  38.85 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.84 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  41.22 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.48 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.59 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.26 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  39.07 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.07 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.94 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.21 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.27 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.98 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.91 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.38 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.87 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.33 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  38.44 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.73 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  40.82 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.12 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  35.05 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.72 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.16 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  37.35 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  222  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  38.3 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>