More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1931 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  53.2 
 
 
362 aa  339  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.03 
 
 
325 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.13 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.26 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  47.96 
 
 
324 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.88 
 
 
325 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.97 
 
 
331 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.87 
 
 
330 aa  275  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.87 
 
 
330 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.8 
 
 
339 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.53 
 
 
328 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.41 
 
 
327 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.81 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.9 
 
 
349 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.46 
 
 
327 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.3 
 
 
325 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.3 
 
 
327 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.63 
 
 
327 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.63 
 
 
328 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.52 
 
 
337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.69 
 
 
328 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 
331 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.26 
 
 
331 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.92 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.54 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.5 
 
 
344 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  40.92 
 
 
330 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.41 
 
 
356 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.21 
 
 
335 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.3 
 
 
330 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.82 
 
 
324 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.89 
 
 
304 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.76 
 
 
338 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.06 
 
 
326 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  41.56 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.72 
 
 
328 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  43.73 
 
 
325 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.62 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  43.39 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
335 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.81 
 
 
326 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  41.18 
 
 
326 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.12 
 
 
334 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.86 
 
 
321 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
326 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  44.37 
 
 
328 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.67 
 
 
325 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.63 
 
 
324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  42.41 
 
 
334 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.52 
 
 
333 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.91 
 
 
335 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.85 
 
 
327 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.26 
 
 
335 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.22 
 
 
323 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.33 
 
 
324 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.72 
 
 
337 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.34 
 
 
333 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.17 
 
 
323 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 
358 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.74 
 
 
325 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40.4 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 
330 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  39.82 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 
314 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.59 
 
 
335 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.2 
 
 
336 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.51 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.83 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  45.08 
 
 
325 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.93 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.79 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  44 
 
 
335 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.53 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.33 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.79 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.89 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.41 
 
 
335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.07 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  43.71 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.33 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39 
 
 
326 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.12 
 
 
335 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.28 
 
 
318 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.68 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.6 
 
 
324 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.95 
 
 
341 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.21 
 
 
325 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.75 
 
 
344 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.34 
 
 
321 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.26 
 
 
322 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>