More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4101 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 328 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  60.67 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  59.68 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  58.33 
 
 		 322 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  55.52 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.55 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.29 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.45 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  45.28 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3021  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.81 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.48 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.3 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.48 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.14 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.54 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.12 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.18 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.68 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.39 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.96 
 
 		 339 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  40.4 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.77 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.69 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.08 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.33 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.12 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  42.66 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.53 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  42.12 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.14 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.61 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.51 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  42.91 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.32 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.32 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.35 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.68 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.38 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.33 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.33 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.88 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0548  hypothetical protein  41.33 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.67 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.76 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.47 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.38 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.51 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.72 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.72 
 
 		 345 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.02 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.78 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.63 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.25 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.39 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.28 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.64 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.69 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  40.8 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  38.94 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.98 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.98 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.92 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.91 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.79 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.51 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.06 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.94 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.65 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.31 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  39.43 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.39 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.47 
 
 		 356 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.11 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.86 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.81 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.37 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>