More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0120 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  69.35 
 
 
344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 
332 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  47.8 
 
 
348 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  47.83 
 
 
328 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.9 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  47.57 
 
 
356 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.51 
 
 
331 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.75 
 
 
325 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.28 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.82 
 
 
327 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.81 
 
 
329 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.24 
 
 
322 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.12 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.92 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.92 
 
 
328 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.1 
 
 
339 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  45.55 
 
 
317 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.19 
 
 
330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  44.52 
 
 
325 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.56 
 
 
318 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.9 
 
 
325 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  43.99 
 
 
334 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  43.92 
 
 
346 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 
328 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 
314 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.82 
 
 
333 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  46.08 
 
 
327 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.42 
 
 
326 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  45.21 
 
 
317 aa  255  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.33 
 
 
351 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.08 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.61 
 
 
323 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  44.29 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.81 
 
 
334 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.19 
 
 
330 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.7 
 
 
331 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.76 
 
 
330 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.44 
 
 
320 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.76 
 
 
330 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.52 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.69 
 
 
328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.77 
 
 
318 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.95 
 
 
335 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.19 
 
 
332 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.99 
 
 
333 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.54 
 
 
339 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 
326 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.03 
 
 
334 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.2 
 
 
325 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
335 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.59 
 
 
358 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.59 
 
 
324 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42.18 
 
 
341 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  42.61 
 
 
337 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.05 
 
 
324 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  45.82 
 
 
331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.95 
 
 
327 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.52 
 
 
353 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.81 
 
 
333 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.15 
 
 
335 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  46.25 
 
 
332 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.11 
 
 
343 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.46 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.82 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.85 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.24 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.68 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.87 
 
 
325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  47.53 
 
 
318 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.61 
 
 
324 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  45.33 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.65 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.37 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.08 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.09 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.64 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.75 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  44.79 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.65 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.51 
 
 
332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.05 
 
 
336 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.37 
 
 
355 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.59 
 
 
332 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.33 
 
 
336 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.95 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  43.05 
 
 
337 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.44 
 
 
331 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  45.07 
 
 
320 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  44.08 
 
 
327 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.67 
 
 
328 aa  242  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44 
 
 
322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  44.88 
 
 
337 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.71 
 
 
332 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.02 
 
 
331 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45.08 
 
 
328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  43.73 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  42.71 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>