More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4085 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  71.6 
 
 		 323 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  70.43 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  60.67 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  52.92 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  45.45 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.86 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3021  hypothetical protein  42.07 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.1 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.56 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.58 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.91 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.67 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.81 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.32 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.76 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.34 
 
 		 355 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.75 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.75 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.43 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.11 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  40.68 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.14 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.13 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.39 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.7 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.7 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.75 
 
 		 304 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.13 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.68 
 
 		 341 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.32 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.37 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.2 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.1 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.86 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  43.77 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.46 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0548  hypothetical protein  37.54 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.67 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.19 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.68 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  44.4 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  37.7 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.96 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.66 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.86 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.16 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.03 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.11 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.79 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.15 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  39.6 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.33 
 
 		 335 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.92 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4951  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.24 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  37.92 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.15 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  41.14 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.49 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.49 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.78 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.32 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.72 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  42.91 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.36 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.16 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.16 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  38.74 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.59 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.73 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  39.33 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.68 
 
 		 360 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.14 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.99 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>