More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5302 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  52.76 
 
 		 326 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5303  hypothetical protein  56.75 
 
 		 325 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.6 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.67 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.29 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.15 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  44.16 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.76 
 
 		 330 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.15 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.96 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.15 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.75 
 
 		 345 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.75 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.24 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.48 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.27 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.61 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  45.4 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.72 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.51 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.3 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.67 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  45 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.63 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.79 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.81 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.3 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.45 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.48 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.14 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.77 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.32 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.48 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.42 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.41 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.81 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.07 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.5 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.59 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  46.18 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.51 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.15 
 
 		 355 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.9 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.75 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.77 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.98 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.92 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.16 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.04 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.14 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.99 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.58 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.6 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.31 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.47 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.81 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  43.41 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 332 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.46 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  43.88 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.96 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.34 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.91 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.98 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.17 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.14 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41.61 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.16 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.48 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.67 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.52 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>