More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5610 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  60.87 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.99 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.77 
 
 		 327 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.57 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.38 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.23 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.63 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.64 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.82 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.6 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.85 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.87 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.99 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.43 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.14 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.59 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.99 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  40.56 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.34 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.14 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.3 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.21 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.42 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.05 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.56 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.63 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.51 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.58 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.18 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.86 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.31 
 
 		 353 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.4 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.26 
 
 		 355 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.14 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.08 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.14 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.43 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  39.8 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.34 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.32 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  39.8 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  38.69 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.59 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.07 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.59 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.09 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.62 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.62 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.36 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.5 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  39.76 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  42.42 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  39.8 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.44 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.02 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.14 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.63 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.8 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.23 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.1 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  40.62 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.04 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.27 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.75 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.73 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.25 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  44.18 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  38.74 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40.97 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.46 
 
 		 317 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.02 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  43.45 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.69 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  39.08 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.09 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.53 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.25 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.2 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  40.27 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.26 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.73 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>