More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1654 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  82.18 
 
 
329 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  80.86 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  76.92 
 
 
328 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  74.92 
 
 
420 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  59.56 
 
 
326 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  60.26 
 
 
337 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  52 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  50.17 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  48.12 
 
 
324 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  49.66 
 
 
325 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  47.83 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.09 
 
 
339 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  47.14 
 
 
324 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.06 
 
 
327 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.95 
 
 
330 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.62 
 
 
328 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  42.24 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.82 
 
 
330 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.82 
 
 
325 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.82 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.38 
 
 
328 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  43.08 
 
 
698 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  46.32 
 
 
330 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.87 
 
 
320 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 
331 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.06 
 
 
335 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.66 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.19 
 
 
335 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.41 
 
 
310 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.95 
 
 
333 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.49 
 
 
330 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.34 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.77 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.46 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.68 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  42.72 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.72 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.14 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.14 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.6 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.04 
 
 
335 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.28 
 
 
331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.12 
 
 
322 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  42 
 
 
337 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.88 
 
 
333 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.02 
 
 
322 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  43.29 
 
 
322 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.25 
 
 
343 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.31 
 
 
326 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.2 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  41.41 
 
 
337 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 
331 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.5 
 
 
332 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  41.8 
 
 
329 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.95 
 
 
338 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 
326 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.7 
 
 
341 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 
328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.33 
 
 
353 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.04 
 
 
318 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.95 
 
 
345 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.95 
 
 
323 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.21 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.95 
 
 
345 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.42 
 
 
304 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.44 
 
 
333 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.29 
 
 
337 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.66 
 
 
335 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.41 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.33 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.12 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.88 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.24 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.83 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  45.08 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  43.79 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  40.81 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.64 
 
 
328 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 
326 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  40.59 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.97 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  43.79 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.06 
 
 
325 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  39.7 
 
 
333 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.87 
 
 
331 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 
330 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.64 
 
 
323 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.62 
 
 
324 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>