More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2701 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  846    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  74.83 
 
 
329 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  74.5 
 
 
329 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  78 
 
 
326 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  70.37 
 
 
328 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  57.55 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  58.22 
 
 
337 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  50.85 
 
 
323 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  47.12 
 
 
324 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  47.02 
 
 
324 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  45.91 
 
 
331 aa  259  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  45.79 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  44.59 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.89 
 
 
339 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.15 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.3 
 
 
333 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.48 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.49 
 
 
330 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.24 
 
 
327 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.24 
 
 
325 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.27 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.56 
 
 
698 aa  239  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.01 
 
 
327 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 
331 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.56 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.88 
 
 
328 aa  236  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.15 
 
 
330 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.93 
 
 
325 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.24 
 
 
325 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.67 
 
 
335 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.92 
 
 
336 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  36.42 
 
 
341 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.27 
 
 
328 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.2 
 
 
310 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.32 
 
 
339 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.53 
 
 
331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.12 
 
 
326 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  37.8 
 
 
341 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.54 
 
 
325 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.24 
 
 
330 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.56 
 
 
353 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.35 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.92 
 
 
335 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.38 
 
 
343 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.81 
 
 
330 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.89 
 
 
356 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.1 
 
 
325 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.17 
 
 
332 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.41 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.41 
 
 
328 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  40.06 
 
 
325 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.81 
 
 
336 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.94 
 
 
351 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.55 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.02 
 
 
322 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.87 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.5 
 
 
333 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.05 
 
 
324 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.25 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.26 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.04 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.94 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.46 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.22 
 
 
328 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  42.28 
 
 
359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.82 
 
 
336 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  38.33 
 
 
337 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.81 
 
 
356 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  40.2 
 
 
335 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43 
 
 
325 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.1 
 
 
353 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.92 
 
 
335 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.53 
 
 
331 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.19 
 
 
332 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.75 
 
 
312 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 
322 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.24 
 
 
325 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.12 
 
 
320 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.8 
 
 
345 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.26 
 
 
334 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  40.73 
 
 
343 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.8 
 
 
345 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.1 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.33 
 
 
328 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  36.96 
 
 
330 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.13 
 
 
325 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.43 
 
 
358 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.25 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  43.52 
 
 
333 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.82 
 
 
333 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 
347 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  42.81 
 
 
330 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  41.43 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  40.48 
 
 
329 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.83 
 
 
329 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>