More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3508 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  86.73 
 
 		 324 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  50.93 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  52.2 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  47.73 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  48.81 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  49.15 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  50.17 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  44.59 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  47.12 
 
 		 420 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  44.26 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.68 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  41.55 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  38.32 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.69 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.97 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.88 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.68 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.6 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  38.64 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  41.02 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  39.94 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  37.65 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.74 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.23 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.74 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  38.1 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.23 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.98 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.44 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.07 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.62 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.63 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.7 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.31 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  39.87 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.07 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  38.54 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.76 
 
 		 344 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  38.64 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  37.96 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  38.85 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  40.62 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  37.29 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  36.73 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  39.24 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  39.24 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  39.02 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  35.67 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  37.63 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.91 
 
 		 698 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.51 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  36.95 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.98 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.22 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.61 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  36.95 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.48 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  36.81 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  37.97 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  35.88 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  37.29 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.31 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  34.78 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.27 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.79 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  35.94 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.29 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  35.81 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.51 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.08 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  36.6 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.74 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  37.29 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.11 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  36.95 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.52 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.54 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.67 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.63 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  38.92 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>