More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4992 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  64.13 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.99 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.05 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.7 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.75 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.91 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.55 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.92 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.77 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.12 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.54 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.54 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.19 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.54 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.8 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  45.33 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.89 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  42.09 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.83 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.92 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.96 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.81 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.16 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.28 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.18 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.73 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.85 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  42.44 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.27 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.27 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.74 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.93 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.02 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.47 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.22 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.52 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.05 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.52 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.28 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.71 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.12 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.04 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.81 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.59 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  42.23 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  40.48 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.83 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.58 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.13 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.94 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  42.05 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.34 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.52 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  43.51 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.68 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.22 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  40.34 
 
 		 323 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.72 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  42.56 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.52 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.45 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.12 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.12 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.06 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  40.2 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2546  hypothetical protein  41.97 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  41.24 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.05 
 
 		 343 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.44 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.22 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.82 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  42.62 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>