More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0127 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  99.69 
 
 		 325 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  80 
 
 		 330 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0181  hypothetical protein  75.94 
 
 		 341 aa  447  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  57.99 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.34 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.34 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.45 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.9 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  48.67 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.34 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.67 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.27 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.46 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.08 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.9 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.57 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.85 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.43 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.82 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.22 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.59 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.98 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.95 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.34 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.94 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.39 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.39 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.01 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.67 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.82 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.4 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.43 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.67 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.75 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.55 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.43 
 
 		 333 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.75 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.01 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.78 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.1 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.61 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.44 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.44 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.78 
 
 		 324 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.78 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.97 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.74 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.31 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.23 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.41 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.78 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.89 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.39 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.12 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.74 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.17 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.9 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.91 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.37 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.72 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.22 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.4 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  43.16 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.47 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.79 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  43.93 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.03 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.25 
 
 		 336 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.83 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.52 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.43 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.17 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.15 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  42.86 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.99 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.39 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.09 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.42 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.09 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.23 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.95 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.4 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  46.37 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>