More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3265 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  53.33 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  52.15 
 
 		 337 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  49.36 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  48 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  51.17 
 
 		 329 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  52 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  50.32 
 
 		 420 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  50.5 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.54 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.06 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.89 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  44.59 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.69 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.75 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.66 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.34 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.44 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.41 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.41 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.67 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.65 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.52 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.55 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.12 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  43.24 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.55 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.23 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.01 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.04 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.3 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.23 
 
 		 335 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.82 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.45 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.14 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.78 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.9 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.81 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.02 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.56 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.23 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.61 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.3 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.97 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  40.06 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.47 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.18 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.73 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.67 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.1 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  41.75 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.21 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.27 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.88 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.06 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.06 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.51 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.38 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.65 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.56 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  39.2 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.22 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.13 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.62 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.9 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.49 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  41.51 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.17 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.05 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.72 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.23 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  45 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  44.95 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.16 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.72 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.63 
 
 		 698 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.08 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.87 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.05 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.58 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.52 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  40.33 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.16 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>