More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4644 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  73.29 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  61.99 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  62.08 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  63.55 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  62.42 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  57.41 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  60.54 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  60.54 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  57.63 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.45 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.75 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.51 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.51 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.2 
 
 		 334 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.88 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.12 
 
 		 349 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.63 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.02 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.57 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.08 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  43.85 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.38 
 
 		 325 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.67 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  44.94 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.73 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.62 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.93 
 
 		 360 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.85 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.04 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.37 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.41 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.75 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.24 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.81 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.21 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 326 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.95 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.95 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.32 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.45 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.45 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.81 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.83 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.29 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.14 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.06 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.31 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  45 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.48 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.46 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.33 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  41.39 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.28 
 
 		 335 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.94 
 
 		 346 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.05 
 
 		 337 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.55 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.95 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.62 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.61 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.18 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  40.68 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  43.22 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.64 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.19 
 
 		 698 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.75 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.27 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.75 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.06 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.56 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  41.72 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.61 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  40.57 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.14 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.56 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.83 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.18 
 
 		 324 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.28 
 
 		 327 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  43.21 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.28 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.98 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.81 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.47 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  41.16 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>