More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1315 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2006  hypothetical protein  77.29 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  55.33 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  54.42 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  53.74 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  49.03 
 
 		 322 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.65 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.11 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.04 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.25 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.26 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  49.08 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.07 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.99 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.77 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  46.21 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  43.59 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.61 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.37 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  41.91 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  47.79 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.32 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.68 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  45.23 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.72 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.96 
 
 		 356 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  46.18 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.14 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  44.59 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.98 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.86 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.66 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.55 
 
 		 338 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.99 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.68 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.8 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.01 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.69 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.86 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  42.91 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.89 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  44.37 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.6 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  45.23 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  42.17 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  44.57 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.47 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.06 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.96 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.68 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.51 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  45.25 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.35 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.91 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.66 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.59 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  39.34 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.4 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.82 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  40.56 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.26 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.26 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.16 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.72 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.68 
 
 		 322 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.72 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.68 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.34 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.49 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.55 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.35 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.13 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.78 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  44.96 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.26 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.6 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.13 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  40.31 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  45.17 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.84 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.62 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.99 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.83 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.69 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.31 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.13 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>