More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5794 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.97 
 
 
326 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.43 
 
 
327 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.82 
 
 
358 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.01 
 
 
325 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  46.31 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.74 
 
 
339 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 
314 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  42.81 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.37 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.88 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.33 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.41 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.68 
 
 
328 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.11 
 
 
330 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.49 
 
 
322 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.03 
 
 
334 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.61 
 
 
323 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.71 
 
 
324 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.68 
 
 
336 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.06 
 
 
318 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  45.08 
 
 
324 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.03 
 
 
328 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  42.86 
 
 
344 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.53 
 
 
324 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  47.53 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.45 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.05 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.14 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.73 
 
 
324 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  43.05 
 
 
330 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.69 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.06 
 
 
345 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.06 
 
 
345 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.62 
 
 
337 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.39 
 
 
328 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.55 
 
 
344 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.01 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.11 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.18 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.11 
 
 
327 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.8 
 
 
353 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.64 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.05 
 
 
360 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.3 
 
 
336 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.69 
 
 
326 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.45 
 
 
349 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.72 
 
 
339 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.61 
 
 
327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  46.01 
 
 
334 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43.97 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.52 
 
 
339 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.07 
 
 
322 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.09 
 
 
331 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.24 
 
 
327 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 
328 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  42.86 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  43.05 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.06 
 
 
356 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.1 
 
 
335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.75 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.23 
 
 
334 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 
328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  45.42 
 
 
339 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.09 
 
 
335 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.2 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.94 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.38 
 
 
329 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.24 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.14 
 
 
310 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.95 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.67 
 
 
322 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  40.49 
 
 
321 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 
328 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  45.25 
 
 
325 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  47.73 
 
 
337 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  45.02 
 
 
328 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.17 
 
 
335 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.91 
 
 
330 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  46.06 
 
 
326 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.88 
 
 
333 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  42.99 
 
 
386 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.68 
 
 
323 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.7 
 
 
325 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  44.19 
 
 
323 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  40.75 
 
 
322 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  39.13 
 
 
322 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.8 
 
 
344 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  40.75 
 
 
326 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  41.2 
 
 
326 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.91 
 
 
330 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.91 
 
 
330 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  44.19 
 
 
323 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  44.93 
 
 
324 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.2 
 
 
323 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.77 
 
 
333 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.19 
 
 
322 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>