More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0114 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  99.37 
 
 
316 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  93.2 
 
 
322 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  88.7 
 
 
350 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  52.51 
 
 
330 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  46.96 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  56.08 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.21 
 
 
345 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.21 
 
 
345 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  45.69 
 
 
329 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.59 
 
 
336 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  46.82 
 
 
332 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  43.94 
 
 
332 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.98 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.05 
 
 
328 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  45.79 
 
 
320 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  278  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.31 
 
 
328 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.96 
 
 
344 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.53 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.64 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.25 
 
 
360 aa  265  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.98 
 
 
322 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.77 
 
 
339 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.23 
 
 
335 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.95 
 
 
328 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.95 
 
 
328 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 
331 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.26 
 
 
334 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.92 
 
 
330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.79 
 
 
334 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  48.36 
 
 
386 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.24 
 
 
335 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.87 
 
 
333 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.22 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.53 
 
 
327 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  44.3 
 
 
332 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.38 
 
 
323 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46 
 
 
325 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.36 
 
 
320 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.3 
 
 
323 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 
328 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43 
 
 
331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.69 
 
 
322 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.62 
 
 
325 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.85 
 
 
324 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.62 
 
 
327 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 
326 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.1 
 
 
318 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.33 
 
 
355 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 
331 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  43.1 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.59 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  43.54 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.61 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.56 
 
 
333 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.49 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.67 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  43.38 
 
 
329 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  43.71 
 
 
329 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.05 
 
 
344 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.81 
 
 
338 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.47 
 
 
322 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.29 
 
 
330 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.52 
 
 
327 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.89 
 
 
330 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.14 
 
 
334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.57 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  40.86 
 
 
321 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.39 
 
 
333 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.76 
 
 
328 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.58 
 
 
326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.67 
 
 
353 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.63 
 
 
323 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  42.33 
 
 
304 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.4 
 
 
330 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.61 
 
 
331 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  39.87 
 
 
336 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  40.92 
 
 
323 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 
324 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.94 
 
 
325 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  41.47 
 
 
323 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  42.37 
 
 
321 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  40.06 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  42.67 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  42.72 
 
 
330 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.82 
 
 
331 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.26 
 
 
337 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  37.97 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.13 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.36 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.82 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.39 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  42.26 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.22 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>