More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2507 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  60.49 
 
 
333 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.5 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.91 
 
 
314 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.67 
 
 
325 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  41.77 
 
 
324 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.15 
 
 
327 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.67 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.29 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.37 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 
326 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  44.05 
 
 
330 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 
328 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.3 
 
 
339 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.72 
 
 
345 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.85 
 
 
336 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.72 
 
 
345 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.12 
 
 
327 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.63 
 
 
327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.33 
 
 
328 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 
328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.12 
 
 
325 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.36 
 
 
325 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.47 
 
 
330 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.47 
 
 
330 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.68 
 
 
332 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.75 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.33 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.87 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.09 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.08 
 
 
331 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.18 
 
 
339 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.72 
 
 
328 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 
331 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.84 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.32 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.32 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.96 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.38 
 
 
333 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.96 
 
 
328 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.63 
 
 
336 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.41 
 
 
323 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.18 
 
 
349 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.94 
 
 
333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.38 
 
 
353 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.6 
 
 
324 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.85 
 
 
351 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.71 
 
 
360 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.13 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.75 
 
 
324 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  41.78 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.75 
 
 
330 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.94 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.93 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.07 
 
 
328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.85 
 
 
333 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.87 
 
 
325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 
331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.91 
 
 
322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.72 
 
 
317 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  42.09 
 
 
315 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.48 
 
 
323 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.86 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.74 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.44 
 
 
322 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  38.38 
 
 
317 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.13 
 
 
318 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.41 
 
 
330 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.58 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.7 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.32 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.12 
 
 
322 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.6 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
327 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.96 
 
 
310 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  39.42 
 
 
322 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 
335 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.31 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  39.27 
 
 
327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.06 
 
 
338 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.99 
 
 
322 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.75 
 
 
346 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.69 
 
 
328 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.24 
 
 
328 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.94 
 
 
326 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
358 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.6 
 
 
328 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.11 
 
 
326 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  42.59 
 
 
335 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.24 
 
 
344 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.73 
 
 
328 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  40.33 
 
 
332 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>