More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3917 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 328 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  72.14 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  41.28 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.05 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  43.38 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.16 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  45.08 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  42.64 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.95 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.74 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.12 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.03 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 		 358 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.84 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.12 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.75 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.23 
 
 		 341 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.08 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  43.99 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 331 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.38 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  44.26 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  46.04 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.13 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.53 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.76 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.06 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.59 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.88 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.85 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.94 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.07 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.37 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  41.86 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  40.94 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.29 
 
 		 324 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.59 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.41 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.48 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.81 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  35.62 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.38 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.79 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  39.41 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.02 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  38.44 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.26 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.26 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.36 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.02 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.56 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.03 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  41.41 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.74 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.4 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.74 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.73 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.3 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.32 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.82 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.33 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.3 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  38.22 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.27 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  37.76 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.19 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.65 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>