More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1722 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  44.71 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  45.77 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.33 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.25 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.35 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  41.88 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.64 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39.46 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.19 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  38.01 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.64 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.87 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.77 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  37.42 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.89 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.54 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.67 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.69 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.94 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.06 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.33 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  37.04 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.87 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.2 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.18 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.21 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.34 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.87 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.6 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.14 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  37.58 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.58 
 
 		 317 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  37.84 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.41 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.27 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.86 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.22 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.59 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.91 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.5 
 
 		 356 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.79 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  37.46 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.92 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.87 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  39.25 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.65 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  34 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.54 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.38 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  39.25 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  39.55 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  37.21 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.46 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.73 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.62 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  40.8 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.07 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  39.57 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.42 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.33 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.86 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.54 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  35.24 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  38.67 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.19 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.79 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  37.91 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.66 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.14 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.3 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.3 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.74 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>