More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6345 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  43.45 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  41.38 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.33 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.51 
 
 		 334 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.98 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  39.2 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  40.91 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.27 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.32 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.58 
 
 		 333 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.26 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.96 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.41 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  36.97 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.97 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  40.51 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.85 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.46 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  37.99 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  38.56 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.93 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.87 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  37.16 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.66 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.87 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.02 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  38.56 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.39 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.96 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.59 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  37.25 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.54 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  34.56 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.26 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.96 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.84 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.79 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  38.76 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  37.54 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.58 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  38.24 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.5 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.17 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  37.17 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.05 
 
 		 332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.53 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  37.92 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.59 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.26 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  37.17 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  35.74 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  37.35 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  35.08 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.55 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  36.95 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  35.96 
 
 		 335 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.18 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  37.67 
 
 		 320 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.91 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.8 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  35.98 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35.17 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  33.65 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  35.91 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  36.11 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  32.82 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  39.12 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.52 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  33.94 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  37.2 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.16 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.6 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.85 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.15 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>