More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3056 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  76.9 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.14 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.84 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  45.54 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.94 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  45.07 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.83 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.91 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.57 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.25 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 314 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.74 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  42.33 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.71 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.53 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  39.74 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.88 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.58 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.17 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.24 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.24 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.91 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  41.74 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  43.98 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  40.36 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.73 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.67 
 
 		 338 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.3 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.74 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  44.18 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.37 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.4 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  39.87 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  41.36 
 
 		 319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  40.19 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.43 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  40.3 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.87 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.24 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  43.43 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.87 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.8 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.81 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.23 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.98 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.88 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.09 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.86 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.82 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.82 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.94 
 
 		 330 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  40.72 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.82 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.13 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.54 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.86 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  41.36 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.47 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.18 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  42.3 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.86 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.46 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.45 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  39.26 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.46 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  41.01 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.7 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.87 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>