More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1021 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  50.93 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  50.32 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  49.67 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  47.7 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.32 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  48.03 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  47.87 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  47.65 
 
 		 325 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  43.75 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  44.01 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  47.9 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  44.67 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  46.69 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  43.61 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  44.03 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  41.81 
 
 		 327 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.64 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.81 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  43.18 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.81 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  42.81 
 
 		 338 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.69 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.12 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  37.81 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.02 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41.67 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.48 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.39 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.84 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  40.67 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.51 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.71 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.47 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.31 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.28 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.93 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.53 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  40.85 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  38.14 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.47 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.66 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.06 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.67 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.86 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.42 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.75 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.08 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.11 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  37.87 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.81 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  39.81 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.87 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  39.68 
 
 		 346 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.06 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.33 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  36.91 
 
 		 332 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.75 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.26 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  38.56 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  37.62 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  40.49 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.61 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.64 
 
 		 331 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.91 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.03 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.55 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.27 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  38.76 
 
 		 343 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.6 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  36.64 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.92 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.4 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.13 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  35.22 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.33 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>