More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4638 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  651    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  84.21 
 
 
325 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  53.99 
 
 
325 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  55.52 
 
 
337 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0753  hypothetical protein  52.63 
 
 
325 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.98 
 
 
328 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.86 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.67 
 
 
330 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.88 
 
 
336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.88 
 
 
320 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.08 
 
 
322 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.43 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  41.86 
 
 
328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.47 
 
 
327 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.47 
 
 
325 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.61 
 
 
327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  39.88 
 
 
332 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.1 
 
 
333 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.23 
 
 
333 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.28 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  42.28 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.19 
 
 
331 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.44 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.25 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.77 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
331 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.51 
 
 
331 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.82 
 
 
349 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.51 
 
 
331 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
328 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.2 
 
 
325 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.5 
 
 
328 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39 
 
 
304 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37 
 
 
330 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
345 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.81 
 
 
322 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.73 
 
 
330 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.13 
 
 
343 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.96 
 
 
324 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.05 
 
 
327 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.57 
 
 
344 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.41 
 
 
326 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  38.7 
 
 
322 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.14 
 
 
328 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.14 
 
 
328 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.74 
 
 
332 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.12 
 
 
324 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.17 
 
 
322 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 
327 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.44 
 
 
320 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.87 
 
 
322 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.33 
 
 
321 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.8 
 
 
334 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  39.26 
 
 
328 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.74 
 
 
328 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  38.65 
 
 
326 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  40.62 
 
 
323 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.34 
 
 
362 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.14 
 
 
331 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.31 
 
 
327 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.48 
 
 
327 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.46 
 
 
346 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  39.68 
 
 
320 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.65 
 
 
325 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.51 
 
 
353 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.96 
 
 
339 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.31 
 
 
325 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.58 
 
 
325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.38 
 
 
324 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  37.93 
 
 
341 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.2 
 
 
332 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  41.42 
 
 
340 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  40.94 
 
 
322 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.46 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.18 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.8 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.41 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.02 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.02 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.75 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.07 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.61 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  39.87 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  37.2 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.69 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.69 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.38 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  36.09 
 
 
333 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.53 
 
 
339 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  39.45 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.38 
 
 
321 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  40.06 
 
 
324 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39 
 
 
337 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.67 
 
 
338 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>