More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3705 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  73.17 
 
 		 325 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  57.33 
 
 		 325 aa  351  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  55.66 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0753  hypothetical protein  52.53 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.67 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.74 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.74 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.62 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.24 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.72 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.89 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.38 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.82 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.31 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.38 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.25 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 330 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.73 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.67 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.12 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.57 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  37.79 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.9 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.12 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  36.33 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  37.62 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.98 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  37.75 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.14 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.03 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.41 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.09 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.48 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.09 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  35.92 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  39.2 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  40.73 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.05 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.71 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.71 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  39.22 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  34.6 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.44 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.45 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.79 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.2 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.91 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  36.33 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.7 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.25 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.25 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.75 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.21 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.46 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.89 
 
 		 332 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  39.09 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.97 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.57 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.49 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.51 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.54 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.67 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.32 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  38.85 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.24 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  34.45 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  37.94 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.69 
 
 		 320 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.95 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  35.78 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  39.08 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>