More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4265 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  68.67 
 
 
328 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2406  hypothetical protein  75.82 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049669  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.39 
 
 
328 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.05 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.67 
 
 
339 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.18 
 
 
332 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.74 
 
 
328 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.47 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.27 
 
 
322 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.2 
 
 
330 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.52 
 
 
353 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 
335 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.47 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.28 
 
 
332 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.08 
 
 
324 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.58 
 
 
328 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.84 
 
 
355 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.28 
 
 
332 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 
324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
332 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 
314 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.82 
 
 
330 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 
328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.64 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  43.61 
 
 
325 aa  245  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.68 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.99 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.48 
 
 
331 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.9 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.9 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.55 
 
 
356 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.23 
 
 
323 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.09 
 
 
327 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.68 
 
 
331 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.94 
 
 
339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.68 
 
 
331 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.77 
 
 
327 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.24 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.8 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.14 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.22 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.23 
 
 
358 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.72 
 
 
322 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.23 
 
 
348 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  41.39 
 
 
324 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  42.33 
 
 
331 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  41.03 
 
 
326 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  43.52 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  41.4 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.51 
 
 
322 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.92 
 
 
331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.81 
 
 
331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.49 
 
 
327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.82 
 
 
343 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  42 
 
 
323 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.5 
 
 
330 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.8 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.33 
 
 
336 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.57 
 
 
320 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.11 
 
 
330 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.49 
 
 
349 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.9 
 
 
327 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.45 
 
 
321 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.13 
 
 
304 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  42.17 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.01 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.39 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  38.59 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  42.24 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  39.63 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.64 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
339 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.13 
 
 
322 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.81 
 
 
335 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.2 
 
 
325 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.94 
 
 
334 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  44 
 
 
325 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  39.26 
 
 
321 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.67 
 
 
310 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.39 
 
 
323 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.7 
 
 
329 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.34 
 
 
351 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  40.12 
 
 
330 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.8 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.78 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  37.5 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.44 
 
 
337 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.93 
 
 
317 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.92 
 
 
325 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.46 
 
 
325 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>