More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4308 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  79.93 
 
 
337 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  82.39 
 
 
331 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  82.39 
 
 
331 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  77.05 
 
 
325 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  56.89 
 
 
333 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  56.46 
 
 
337 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  58.36 
 
 
332 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  57.67 
 
 
332 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.17 
 
 
339 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.48 
 
 
339 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.48 
 
 
325 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.38 
 
 
328 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.38 
 
 
328 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.35 
 
 
328 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.18 
 
 
328 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.6 
 
 
332 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.6 
 
 
327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.41 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.31 
 
 
327 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  43.33 
 
 
329 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 
328 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.36 
 
 
339 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.24 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  43 
 
 
329 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 
331 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.68 
 
 
325 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.64 
 
 
336 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.09 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.09 
 
 
327 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.31 
 
 
328 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  43.57 
 
 
327 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.29 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.29 
 
 
317 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.01 
 
 
320 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.42 
 
 
338 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.67 
 
 
324 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.06 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.95 
 
 
317 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.62 
 
 
335 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  41.59 
 
 
330 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 
327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.95 
 
 
335 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 
335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.44 
 
 
324 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.54 
 
 
325 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.97 
 
 
336 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.92 
 
 
325 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  40.33 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.24 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  42.95 
 
 
333 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.16 
 
 
345 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 
332 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.16 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.8 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.21 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.15 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.67 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.45 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.69 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.66 
 
 
327 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.37 
 
 
329 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  41.02 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.19 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  40.06 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.37 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.48 
 
 
326 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.14 
 
 
330 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.14 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.36 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.8 
 
 
331 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.01 
 
 
322 aa  231  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  41.16 
 
 
325 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.75 
 
 
332 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 
329 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 
322 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.06 
 
 
320 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.75 
 
 
324 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.38 
 
 
339 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 
366 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.36 
 
 
333 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  42.05 
 
 
359 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.75 
 
 
341 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  42.23 
 
 
314 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.35 
 
 
322 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 
328 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.85 
 
 
326 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.45 
 
 
358 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42 
 
 
323 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>