More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3875 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  81.94 
 
 		 337 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  77.05 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  78.22 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  78.22 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  65.89 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  61.18 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  54.43 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  54.33 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  55.37 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.25 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  49.83 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.73 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.08 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.08 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.38 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.89 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.94 
 
 		 336 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.95 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.78 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.59 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.47 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.42 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.88 
 
 		 336 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.85 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.62 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.19 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.19 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.08 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.22 
 
 		 335 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.69 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  47.06 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.27 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.64 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  45.62 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.69 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.69 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  43.3 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.45 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.94 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.52 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.99 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.77 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.64 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.85 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.31 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.12 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.08 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  42.57 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.98 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 326 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.51 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  42.38 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.11 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.82 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  42.23 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.48 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  42.23 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.86 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.41 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.38 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.51 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.72 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.61 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  45.7 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  41.88 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.36 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.5 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.52 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  41.08 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  40.72 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.89 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  40.99 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.14 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.68 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.14 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.2 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>