More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3733 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  82.35 
 
 
337 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  82.39 
 
 
343 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  76.92 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  58.77 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  57.72 
 
 
333 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  60.78 
 
 
332 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  55.08 
 
 
332 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  52.98 
 
 
351 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.44 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.23 
 
 
328 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.99 
 
 
339 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.82 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  44.17 
 
 
330 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.87 
 
 
339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.08 
 
 
336 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.41 
 
 
327 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.25 
 
 
331 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.14 
 
 
339 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.6 
 
 
332 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.1 
 
 
328 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.32 
 
 
335 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 
328 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.95 
 
 
328 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.48 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  44.11 
 
 
386 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.92 
 
 
344 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 
348 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.33 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  42.58 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.14 
 
 
333 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.82 
 
 
326 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.1 
 
 
331 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 
329 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.53 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.09 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.54 
 
 
336 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  45.39 
 
 
334 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.29 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.47 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.81 
 
 
337 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 
335 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 
327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  40.06 
 
 
321 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  42.23 
 
 
325 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.69 
 
 
320 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.48 
 
 
310 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  40.49 
 
 
324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.97 
 
 
360 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  43.26 
 
 
328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 
328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.53 
 
 
322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.12 
 
 
330 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 
358 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  42.23 
 
 
325 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.87 
 
 
335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.53 
 
 
327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  39.55 
 
 
324 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  44.3 
 
 
326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.95 
 
 
334 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.37 
 
 
328 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.13 
 
 
325 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.47 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  41.06 
 
 
336 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.3 
 
 
335 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  41.54 
 
 
352 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.94 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.94 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.4 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.38 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.48 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  40.85 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.92 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.69 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  42.02 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.91 
 
 
318 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.09 
 
 
343 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.63 
 
 
331 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.03 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  40.91 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.13 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.19 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  41.2 
 
 
324 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.51 
 
 
326 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  42.01 
 
 
346 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.61 
 
 
334 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  41.25 
 
 
329 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41 
 
 
338 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.55 
 
 
349 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.53 
 
 
327 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>