More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3886 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  717    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  53.21 
 
 
337 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  54.52 
 
 
331 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  54.52 
 
 
331 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  54.33 
 
 
325 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  51.62 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  45.83 
 
 
337 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  48.48 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  44.75 
 
 
333 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  43.67 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.92 
 
 
325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.21 
 
 
323 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.69 
 
 
339 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.64 
 
 
327 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.07 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.22 
 
 
328 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.59 
 
 
366 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.88 
 
 
334 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.74 
 
 
328 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.08 
 
 
326 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  39.27 
 
 
334 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.42 
 
 
339 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 
328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.24 
 
 
314 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.33 
 
 
323 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.31 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.18 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.47 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.41 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.94 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.63 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  38.44 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.33 
 
 
330 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  36.28 
 
 
327 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.4 
 
 
332 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.02 
 
 
330 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.33 
 
 
330 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.31 
 
 
339 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.95 
 
 
335 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.53 
 
 
332 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.92 
 
 
326 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.94 
 
 
327 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.8 
 
 
335 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.75 
 
 
348 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.02 
 
 
336 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.59 
 
 
332 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.12 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.07 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.71 
 
 
337 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.62 
 
 
327 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.28 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.55 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.48 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.38 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.76 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.48 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.32 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.95 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.33 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.46 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.26 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.95 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.44 
 
 
322 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.68 
 
 
330 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.38 
 
 
338 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.59 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.59 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38.71 
 
 
321 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.61 
 
 
338 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.04 
 
 
356 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.94 
 
 
310 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 
328 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  37.17 
 
 
328 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 
330 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 
335 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 
329 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.11 
 
 
331 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.11 
 
 
331 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.42 
 
 
334 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  39.86 
 
 
330 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.14 
 
 
325 aa  209  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.8 
 
 
327 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.04 
 
 
327 aa  209  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.49 
 
 
326 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  40.96 
 
 
328 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  38.91 
 
 
332 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  37.92 
 
 
336 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.84 
 
 
325 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.86 
 
 
324 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  36.58 
 
 
324 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>