More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3329 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.95 
 
 
328 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  43.73 
 
 
331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.72 
 
 
333 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 
332 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.09 
 
 
327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.57 
 
 
328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.25 
 
 
326 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  41.85 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  42.68 
 
 
328 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  41.95 
 
 
325 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  41.95 
 
 
325 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.58 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.28 
 
 
326 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.58 
 
 
328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  43.17 
 
 
322 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  42.31 
 
 
333 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.33 
 
 
325 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.02 
 
 
333 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.26 
 
 
339 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.04 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  40.06 
 
 
328 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  43.09 
 
 
344 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
327 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  43.85 
 
 
338 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  44.56 
 
 
361 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.81 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.27 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.47 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.51 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.44 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 
335 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.28 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.47 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.83 
 
 
323 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.14 
 
 
317 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.42 
 
 
331 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.61 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.71 
 
 
326 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.13 
 
 
327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.53 
 
 
330 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.88 
 
 
324 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.11 
 
 
339 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.94 
 
 
320 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.28 
 
 
339 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.8 
 
 
337 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.37 
 
 
336 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.6 
 
 
335 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  42.76 
 
 
337 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.47 
 
 
328 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.28 
 
 
327 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.85 
 
 
339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.07 
 
 
337 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.28 
 
 
325 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.5 
 
 
335 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.74 
 
 
322 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.59 
 
 
332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.45 
 
 
330 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  38.77 
 
 
330 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  40.25 
 
 
340 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 
326 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.9 
 
 
325 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.89 
 
 
348 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.33 
 
 
310 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  40.86 
 
 
328 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  40.62 
 
 
321 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  39.32 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  39.01 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.61 
 
 
698 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.56 
 
 
335 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.22 
 
 
326 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.16 
 
 
328 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 
329 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.53 
 
 
353 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  38.33 
 
 
332 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  39.38 
 
 
320 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.74 
 
 
325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.69 
 
 
325 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  42.76 
 
 
333 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.51 
 
 
353 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  40.69 
 
 
327 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.94 
 
 
356 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.63 
 
 
320 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.56 
 
 
323 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.93 
 
 
355 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.81 
 
 
327 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  38.27 
 
 
326 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  42 
 
 
328 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.16 
 
 
328 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.96 
 
 
336 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  41.33 
 
 
329 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
331 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.14 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>