More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3986 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  84.21 
 
 
326 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  55.59 
 
 
337 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  55.28 
 
 
325 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0753  hypothetical protein  53.85 
 
 
325 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.33 
 
 
330 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.33 
 
 
330 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.46 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.25 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.23 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.61 
 
 
338 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.08 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.8 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.14 
 
 
341 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.88 
 
 
333 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.27 
 
 
327 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  40.37 
 
 
333 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.25 
 
 
320 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.73 
 
 
329 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.74 
 
 
327 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  43.29 
 
 
328 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
331 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.33 
 
 
345 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.33 
 
 
345 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  42.09 
 
 
305 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.88 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.69 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 
332 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.36 
 
 
328 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.36 
 
 
328 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  41.58 
 
 
320 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.32 
 
 
335 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  42.42 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  39.51 
 
 
332 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.73 
 
 
337 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.12 
 
 
336 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.67 
 
 
330 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.19 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.89 
 
 
324 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.99 
 
 
353 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.19 
 
 
331 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.2 
 
 
346 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.8 
 
 
338 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  38.99 
 
 
345 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.53 
 
 
341 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  38.94 
 
 
321 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.01 
 
 
320 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.08 
 
 
339 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.88 
 
 
328 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.29 
 
 
332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.63 
 
 
322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  41.69 
 
 
322 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.18 
 
 
344 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.57 
 
 
323 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.39 
 
 
323 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  40.86 
 
 
322 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  40.47 
 
 
327 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.22 
 
 
325 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.33 
 
 
335 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.19 
 
 
327 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.3 
 
 
355 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.92 
 
 
336 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.59 
 
 
334 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.12 
 
 
360 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.8 
 
 
349 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.4 
 
 
321 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.42 
 
 
322 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.71 
 
 
331 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 
322 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.94 
 
 
339 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.59 
 
 
330 aa  222  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.12 
 
 
324 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.93 
 
 
324 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.6 
 
 
330 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.73 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  39.88 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.91 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.03 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.44 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.84 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.61 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.62 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  40.07 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 
328 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.5 
 
 
332 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  39.87 
 
 
323 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.07 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  41.75 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.26 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.25 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.88 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>