More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2485 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  641    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  73.29 
 
 		 321 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  71.12 
 
 		 322 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  66.25 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  65.12 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  62.08 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  62.42 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  60.44 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  60.77 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  59.53 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  59.69 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.71 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.33 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.67 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.19 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.19 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.05 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.2 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.95 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.27 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.63 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.83 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.69 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.11 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.03 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.89 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.32 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.55 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.55 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  44.19 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.95 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.14 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.52 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.79 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.19 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  42.14 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.49 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.62 
 
 		 339 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  42.55 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.59 
 
 		 358 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.75 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.62 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.15 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.38 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.38 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.95 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.77 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.96 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.43 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.73 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.69 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.44 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  40.92 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.09 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.57 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  45.13 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.53 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.77 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.89 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.69 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.68 
 
 		 698 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.04 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.25 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  44.34 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.61 
 
 		 326 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  40.6 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  40.88 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.6 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.2 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.19 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.14 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.18 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  45.48 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.91 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  41.28 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.52 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.26 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.99 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.67 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.42 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>