More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1607 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  87.2 
 
 		 345 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  47.83 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  45.68 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.48 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.48 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.19 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.42 
 
 		 322 aa  259  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.52 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  43.39 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  42.76 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  41.84 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  41.72 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.06 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.71 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.67 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.18 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  42.72 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.3 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.89 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.47 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.75 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.16 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.31 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.05 
 
 		 331 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.2 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.6 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1408  hypothetical protein  42.07 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.26 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.26 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.93 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  39.16 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.33 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.07 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.06 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.25 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.33 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.78 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.93 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.61 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.44 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.25 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.4 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  35.57 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.54 
 
 		 304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  40.53 
 
 		 332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.46 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.89 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.84 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.13 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.89 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.42 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  39.67 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.94 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.13 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  36.73 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.75 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.07 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.62 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.37 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.93 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.09 
 
 		 336 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  38.96 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.3 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.59 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.09 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  37.37 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.16 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  40.43 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  39.87 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  37.65 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.01 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.29 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.56 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>