More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3907 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  48.29 
 
 
314 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  47.19 
 
 
336 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  45.03 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.23 
 
 
330 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.94 
 
 
322 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43 
 
 
330 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.92 
 
 
322 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.59 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  44.52 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.17 
 
 
330 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.26 
 
 
320 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  46.31 
 
 
322 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.91 
 
 
328 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.91 
 
 
328 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.73 
 
 
317 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.01 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.41 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.82 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.93 
 
 
333 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  46.25 
 
 
327 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.39 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.99 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.64 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.06 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.72 
 
 
324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.79 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.59 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  42.67 
 
 
325 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 
331 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.35 
 
 
325 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 
339 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.43 
 
 
337 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 
331 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.65 
 
 
332 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  42.28 
 
 
337 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  42.95 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  41.67 
 
 
321 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.94 
 
 
322 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.2 
 
 
330 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  42.47 
 
 
319 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  45.03 
 
 
327 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  43.51 
 
 
325 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.24 
 
 
332 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.06 
 
 
322 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.23 
 
 
325 aa  235  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.23 
 
 
327 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  44.15 
 
 
338 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.73 
 
 
325 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.02 
 
 
331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  41.51 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.2 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.65 
 
 
331 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.17 
 
 
325 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
314 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.03 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.51 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  42.14 
 
 
334 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.57 
 
 
353 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  38.89 
 
 
327 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  46.51 
 
 
322 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.18 
 
 
355 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.28 
 
 
328 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.47 
 
 
323 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 
328 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.82 
 
 
330 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.14 
 
 
339 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1056  hypothetical protein  42.62 
 
 
333 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.32 
 
 
326 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.08 
 
 
320 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.53 
 
 
327 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  41.14 
 
 
321 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.33 
 
 
336 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.44 
 
 
336 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.86 
 
 
323 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.51 
 
 
328 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.14 
 
 
338 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.39 
 
 
324 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.33 
 
 
337 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.79 
 
 
345 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.79 
 
 
345 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.47 
 
 
334 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  43.94 
 
 
321 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.1 
 
 
333 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  41.72 
 
 
324 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.18 
 
 
339 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  40.67 
 
 
323 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.47 
 
 
343 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.59 
 
 
341 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  41.14 
 
 
327 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.71 
 
 
333 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.13 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  38.24 
 
 
333 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  42.24 
 
 
336 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>