More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3799 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.81 
 
 
327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  41.61 
 
 
327 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.81 
 
 
325 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 
335 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.71 
 
 
330 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.75 
 
 
328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.45 
 
 
328 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.68 
 
 
332 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.31 
 
 
322 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.67 
 
 
334 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.37 
 
 
333 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.1 
 
 
339 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.46 
 
 
327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.55 
 
 
325 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  40.34 
 
 
357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 
322 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.49 
 
 
322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.33 
 
 
326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.64 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.23 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.42 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.68 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 
314 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.67 
 
 
335 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.66 
 
 
337 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.86 
 
 
341 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.86 
 
 
332 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 
328 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.11 
 
 
331 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.11 
 
 
331 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.42 
 
 
326 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.27 
 
 
325 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.25 
 
 
322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.37 
 
 
324 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.67 
 
 
345 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.67 
 
 
345 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.2 
 
 
336 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  40.18 
 
 
331 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  41.84 
 
 
347 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.13 
 
 
330 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.73 
 
 
331 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.52 
 
 
328 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.53 
 
 
360 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.33 
 
 
356 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  40.94 
 
 
340 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.95 
 
 
325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  42.71 
 
 
321 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  36.94 
 
 
326 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.63 
 
 
344 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.18 
 
 
331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.51 
 
 
328 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.33 
 
 
304 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  37.93 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  41.75 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.94 
 
 
327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.11 
 
 
356 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
332 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.36 
 
 
320 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.87 
 
 
324 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.18 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.66 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.41 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  38.98 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.12 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.19 
 
 
337 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.66 
 
 
325 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.86 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  39.36 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  39.33 
 
 
342 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.48 
 
 
318 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.99 
 
 
321 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.19 
 
 
333 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.82 
 
 
344 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.84 
 
 
328 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.87 
 
 
332 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 
341 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.97 
 
 
338 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.46 
 
 
339 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.91 
 
 
333 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.98 
 
 
322 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  37.71 
 
 
338 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.21 
 
 
326 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.57 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.89 
 
 
327 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.54 
 
 
325 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.31 
 
 
327 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.74 
 
 
334 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.64 
 
 
327 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.15 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.07 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  39.68 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  40.38 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>