More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4275 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 341 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.43 
 
 		 328 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.42 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.3 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  43.77 
 
 		 328 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.24 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.2 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.9 
 
 		 324 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.41 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5507  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.08 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.33 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.14 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.07 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  40.53 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.2 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  40.6 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.37 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.06 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.82 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  43.92 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 358 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  39.6 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.6 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.78 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  41.5 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.33 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.4 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.69 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.02 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.95 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.81 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  38.17 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.31 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.2 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.55 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.91 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.86 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.94 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.57 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.53 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.26 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  40.07 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  41.37 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  40.6 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.05 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.14 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.31 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.75 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.53 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.81 
 
 		 698 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.4 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.62 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.53 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  42.21 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.91 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.84 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  41.52 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.8 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  40.34 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  40.58 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  40.53 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.41 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.27 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.48 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  41.3 
 
 		 327 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.46 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.13 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.59 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>