More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4203 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 335 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  49.85 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.54 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.71 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.17 
 
 		 339 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.38 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.37 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.39 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.85 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.2 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.85 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.96 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.48 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.77 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.75 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.39 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.18 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.37 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.79 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.5 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  42.5 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  45 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.64 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.1 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.12 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.95 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  40.95 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.09 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  42.59 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.3 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.48 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.63 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.77 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.19 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.14 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.68 
 
 		 334 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.61 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  45.08 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.5 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.75 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.94 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  43.63 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.47 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  44.82 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  45.3 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.37 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  44.83 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.94 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  43.53 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  42.99 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.52 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.88 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.68 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  42.06 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.3 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.67 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.26 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.41 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.16 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  42.53 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  43.5 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.52 
 
 		 336 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.75 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.29 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  43.54 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.6 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.44 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.27 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  41.2 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  43.52 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  42.42 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  44.3 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  42.36 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.24 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.53 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>