More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0621 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  84.95 
 
 
327 aa  547  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  52.3 
 
 
331 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.67 
 
 
330 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.34 
 
 
325 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.85 
 
 
328 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.24 
 
 
339 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.09 
 
 
328 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.09 
 
 
328 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.56 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.54 
 
 
336 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.82 
 
 
325 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.95 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.16 
 
 
325 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.16 
 
 
327 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.89 
 
 
322 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.11 
 
 
334 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.33 
 
 
328 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 
322 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.39 
 
 
330 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.56 
 
 
344 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.47 
 
 
325 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.88 
 
 
339 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.22 
 
 
330 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  45.58 
 
 
338 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  39.13 
 
 
329 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.32 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.26 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.42 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.02 
 
 
314 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.42 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.16 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.5 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.73 
 
 
336 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.85 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  44.18 
 
 
328 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.59 
 
 
343 aa  242  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.54 
 
 
328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.61 
 
 
328 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 
335 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.31 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.31 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.6 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.56 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.97 
 
 
339 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.07 
 
 
320 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.68 
 
 
335 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.55 
 
 
326 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.93 
 
 
337 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.31 
 
 
331 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.34 
 
 
325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.6 
 
 
304 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.31 
 
 
332 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.59 
 
 
330 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.57 
 
 
328 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.69 
 
 
327 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  41.69 
 
 
328 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 
331 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.81 
 
 
320 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.6 
 
 
327 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  43.23 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.57 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.11 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.67 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.08 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.56 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.98 
 
 
333 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.08 
 
 
317 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3881  hypothetical protein  43.58 
 
 
312 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.78 
 
 
335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.06 
 
 
330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.27 
 
 
353 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  41.78 
 
 
319 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.57 
 
 
335 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.38 
 
 
332 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.26 
 
 
333 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.4 
 
 
325 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.2 
 
 
331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.33 
 
 
325 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  39.8 
 
 
336 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
326 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.43 
 
 
324 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.93 
 
 
328 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.93 
 
 
332 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.74 
 
 
338 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.82 
 
 
331 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.59 
 
 
349 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.5 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.75 
 
 
341 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  43.94 
 
 
320 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.59 
 
 
330 aa  226  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.59 
 
 
330 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.48 
 
 
333 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  43.86 
 
 
325 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.26 
 
 
335 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.85 
 
 
356 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  39.88 
 
 
316 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>