More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1395 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  79.69 
 
 
325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  78.95 
 
 
323 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  66.87 
 
 
326 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  42.72 
 
 
323 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.22 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.22 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.76 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.91 
 
 
339 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.05 
 
 
318 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.24 
 
 
339 aa  244  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.92 
 
 
327 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  42.9 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.67 
 
 
352 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.39 
 
 
329 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.05 
 
 
335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.43 
 
 
330 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.77 
 
 
328 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.64 
 
 
356 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.69 
 
 
320 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.52 
 
 
324 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.99 
 
 
321 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.49 
 
 
322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.33 
 
 
331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42 
 
 
330 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.67 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.13 
 
 
323 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.51 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.81 
 
 
323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.27 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.96 
 
 
325 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.51 
 
 
332 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.06 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.09 
 
 
334 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.05 
 
 
339 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.38 
 
 
318 aa  231  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 
331 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.06 
 
 
327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.27 
 
 
343 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.19 
 
 
331 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.07 
 
 
337 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.19 
 
 
351 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.09 
 
 
325 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.8 
 
 
332 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.9 
 
 
338 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.98 
 
 
330 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.52 
 
 
343 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.56 
 
 
325 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 
328 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  38.24 
 
 
333 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.33 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.62 
 
 
336 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.87 
 
 
336 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.14 
 
 
334 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.8 
 
 
328 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  39.8 
 
 
332 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  37.78 
 
 
327 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.89 
 
 
328 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.16 
 
 
329 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 
327 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.56 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.12 
 
 
330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.58 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  39.8 
 
 
326 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.8 
 
 
341 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.89 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.26 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.7 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.96 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.86 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.47 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.86 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  37.33 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.64 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.83 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.2 
 
 
325 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  40.19 
 
 
330 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.75 
 
 
349 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.54 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.48 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2124  hypothetical protein  39.53 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.67 
 
 
330 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.27 
 
 
330 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.71 
 
 
325 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.73 
 
 
360 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37.8 
 
 
334 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.89 
 
 
344 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.8 
 
 
337 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5962  hypothetical protein  41.7 
 
 
322 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.39 
 
 
337 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.82 
 
 
332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.04 
 
 
334 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.18 
 
 
345 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.87 
 
 
339 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>