More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3341 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  80.92 
 
 		 323 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  80 
 
 		 320 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  68.1 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  43.43 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.22 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.41 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  41.3 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.94 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.68 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.45 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.32 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.52 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.51 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.65 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.43 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.31 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.47 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.54 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.24 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.8 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.83 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.3 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.13 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.87 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.32 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.97 
 
 		 345 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.97 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.61 
 
 		 360 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.22 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.19 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.34 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  36.31 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.8 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.68 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.22 
 
 		 356 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.38 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.53 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.28 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.29 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.54 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.06 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.33 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38.98 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.74 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  35.98 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.95 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.26 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.35 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.06 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  38.03 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  37.42 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  37.42 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.01 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  39.6 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  38.06 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.48 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.89 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.93 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  39.6 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  38.94 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.21 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.34 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.25 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.93 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.26 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.81 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.66 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5007  hypothetical protein  38.46 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  38.59 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.25 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.33 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.21 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  37.74 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  37.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>