More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3438 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  68.4 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  67.79 
 
 		 325 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  66.87 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  41.1 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.64 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.26 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.37 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.67 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.93 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.52 
 
 		 337 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.78 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.9 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.43 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.48 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.19 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.7 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.19 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.25 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.66 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.01 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.95 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.67 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.06 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.98 
 
 		 320 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.32 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  40.48 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.14 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.81 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.91 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.32 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.78 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  38.13 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.45 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  44.07 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.48 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.63 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.19 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.58 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.58 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.5 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  45.09 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  42.61 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 330 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.8 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.39 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.41 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.87 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.54 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  39.87 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.77 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.54 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.74 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  38.46 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.69 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.23 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  37.03 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.67 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.29 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40.13 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.01 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.35 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  37.82 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.49 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  38.79 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.81 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.4 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.74 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  38.04 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.74 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.54 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.69 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.81 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.18 
 
 		 321 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.87 
 
 		 341 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 		 346 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.04 
 
 		 349 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>