More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0164 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  57.58 
 
 
341 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  58.06 
 
 
328 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  53.87 
 
 
324 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  47.88 
 
 
332 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  46.53 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  44.55 
 
 
332 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.37 
 
 
335 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.86 
 
 
335 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.13 
 
 
325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.46 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.08 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.08 
 
 
345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.76 
 
 
327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.96 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 
328 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.19 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.19 
 
 
330 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41 
 
 
328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.33 
 
 
328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.07 
 
 
314 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.08 
 
 
325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.02 
 
 
339 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.2 
 
 
339 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 
331 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.62 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.65 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.74 
 
 
331 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.28 
 
 
339 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 
328 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.06 
 
 
336 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.87 
 
 
339 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.61 
 
 
320 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.33 
 
 
330 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 
328 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.07 
 
 
327 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  40.47 
 
 
322 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  42.6 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.51 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  40.47 
 
 
474 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.97 
 
 
328 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.58 
 
 
360 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 
348 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  34.86 
 
 
324 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.63 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.13 
 
 
322 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  40.98 
 
 
334 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  37.86 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  38.7 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.62 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.82 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.28 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.31 
 
 
327 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.89 
 
 
333 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.99 
 
 
335 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.42 
 
 
330 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.42 
 
 
330 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.33 
 
 
333 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.21 
 
 
332 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.35 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.48 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.33 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  36.58 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  40.06 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.05 
 
 
346 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  41.41 
 
 
361 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.25 
 
 
334 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.31 
 
 
331 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.72 
 
 
338 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
328 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  40.73 
 
 
343 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.42 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.71 
 
 
329 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.91 
 
 
328 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.21 
 
 
356 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.87 
 
 
327 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  39.02 
 
 
337 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  40 
 
 
386 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.59 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.56 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.29 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.11 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.91 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.39 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.86 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  37.71 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.28 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  39 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.21 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.59 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>