More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4316 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  66.44 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  62.91 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  59.53 
 
 		 332 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  49.34 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  49.49 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.74 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.8 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 331 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.24 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.78 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.09 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.09 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.54 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.07 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 314 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.41 
 
 		 331 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.91 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  41.81 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.68 
 
 		 330 aa  229  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.98 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  41.41 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.67 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.1 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.67 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.44 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.63 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.33 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.49 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  42.68 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.53 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.59 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.3 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.47 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  39.56 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.82 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.45 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  37.79 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.88 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  41.09 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  38.94 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.69 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.23 
 
 		 331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  38.49 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.69 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.16 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.16 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  42.09 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.58 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.44 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  42.36 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.84 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.93 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.44 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.79 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.34 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.41 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40.21 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.56 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.34 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.53 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.81 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.86 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  40.96 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.97 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.08 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.64 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.76 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>